Jest przełożonym wszystkich pracowników i studentów. Rektor kieruje działalnością Uczelni i reprezentuje ją na zewnątrz. Rektor podejmuje decyzje dotyczące funkcjonowania Uczelni, nie zastrzeżone dla innych organów Uczelni. Rektor jest organem jednoosobowym Uczelni.

Do zadań Senatu należy:

• ustalanie kierunków rozwoju i programów dydaktycznych Uczelni,

• opracowywanie i uchwalanie programów nauczania i planów studiów na poszczególnych kierunkach z uwzględnieniem minimalnych wymogów programowych Rady Głównej, a także analiza działalności dydaktycznej i badawczej jednostek organizacyjnych Uczelni,

• uchwalanie regulaminu studiów,

Administracja Uczelni jest powierzona Kanclerzowi Uczelni, który kieruje administracją i gospodarką Uczelni oraz podejmuje decyzje dotyczące mienia Uczelni.

Konwent jest organem inicjującym, opiniodawczym i doradczym Uczelni. Do zadań Konwentu należy w szczególności:

• wyrażanie wniosków i opinii w zakresie kierunków rozwoju i programów kształcenia Uczelni,

• uchwalanie zaleceń w sprawie zakresu, zasad i form współdziałania Uczelni z innymi instytucjami i organizacjami w kraju i za granicą.

• opiniowanie planu rzeczowo-finansowego Uczelni.  

Samorząd studencki tworzą studenci uczelni, jest on niezależną i samorządną organizacją reprezentującą ogół studentów WSTI. Samorząd reprezentuje Rada Studentów wyłaniana corocznie w uczelnianych wyborach.